ベイラー医科大学の科学者チームとテクノロジー企業 SandboxAQ は、分子接着剤を発見するためのフラグメントベースの方法を開発しました。彼らは、このワークフローは、 自然のコミュニケーション これは、2 つのタンパク質を結合させる粘着性の小さな分子を見つけるための、より安価でアクセスしやすい方法です (DOI: 10.1038/s41467-026-77657-z)。
Baylor チームは、ハイスループット プロテオミクスを使用して、免疫関連シグナル伝達タンパク質である VAV1 を分解する活性について、フェニルグルタルイミドに焦点を当てたフラグメントのライブラリーをスクリーニングすることから始めました。スクリーニングプロセスでは、細胞をフラグメントで処理した後の細胞プロテオームの変化を観察し、このスクリーニングプロセスにより 2 つの分子が得られました。
化合物 11 および 12 と呼ばれるこれら 2 つの分子は、当初は非常に弱い分解剤でした。しかし、目標は、クラス最高の VAV1 分解酵素をすぐに見つけることではありませんでした。その戦略は、小さなライブラリをスキャンして、将来的により優れた接着剤に開発できるあらゆる種類のヒット曲を探すことでした。
そこでSandboxAQが介入しました。SandboxAQはリガンドとVAV1タンパク質の間の相互作用をモデル化し、科学者に化合物をさらに修飾してより優れた接着剤を作る方法についての洞察を与えました。
「私たちがフラグメントから始めることを好む理由は、分子が小さいと化学空間をカバーするのが比較的簡単だからです。その後、弱いヒットを見つけて、それらを進化させ始めます」とベイラー次世代治療センターの所長であるジン・ワンは言う。 「これははるかに費用対効果が高く、実現可能だと思います。」
「少なくとも、分子接着剤のフラグメントベースの創薬が可能になるという証拠はあります。これは非常に興味深いことです」と、SandboxAQ の創薬担当バイスプレジデントである Andrea Bortolato 氏は述べています。
SandboxAQ は、Google の親会社である Alphabet から生まれた人工知能ソフトウェア会社です。同社が AI を活用した創薬に進出するのはこれが初めてではない。はアストラゼネカ、サノフィ、カリフォルニア大学サンフランシスコ校と既存のパートナーシップを結んでいます。
